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DIAGNÓSTICO MICROBIOLÓGICO SEROLÓGICO Y MOLECULAR

SIGLAS
BAL Lavado broncoalveolar   ITS Infecciones de transmisión sexual
BK+ Baciloscopia positiva   LCR Líquido cefalorraquídeo
CMV Citomegalovirus   LMP Leucoencefalopatía multifocal progresiva
CV Carga viral   MNTB Micobacterias no tuberculosas
EBNA Anticuerpos frente al antígeno nuclear del VEB   MTB Mycobacterium tuberculosis
EIA Enzimo-inmuno-análisis   MTBc Mycobacterium tuberculosis complex
ELFA Inmunoensayo fluorescente   PCR Reacción en cadena de la polimerasa
ELISA Inmunoabsorción ligado a enzimas   PCR TR PCR en tiempo real
EPI Enfermedad pélvica inflamatoria   PTLD Enfermedad linfoproliferativa post-trasplante
HBC Hepatitis B crónica   SNC Sistema nervioso central
HBO Hepatitis B oculta   TMO Trasplante de médula ósea
IB Inmunoblot   VCA Anticuerpos frente a la cápside del VEB
IC Inmunocromatografía   VEB Virus Epstein-Barr
ID Inmunodeprimido   VHA Virus de la hepatitis A
IFI Inmunofluorescencia indirecta   VHB Virus de la hepatitis B
HTLV Virus linfotrópico de células T humanas   VHC Virus de la hepatitis C
IgA Anticuerpos IgA   VHS Virus herpes simple
IgG Anticuerpos IgG   VIH Virus de la inmunodeficiencia humana
IgM Anticuerpos IgM   VVZ Virus varicela-zoster
IGRA Ensayo de liberación de interferon gamma   UNG Uretritis no gonocócica
IQL Inmuno-quimio-luminiscencia      

 

 

MICROORGANISMOS. DIAGNÓSTICO SEROLÓGICO

MICROORGANISMO TÉCNICA OBJETIVO DIAGNÓSTICO MUESTRA TUBO REQUISITOS DATOS CLÍNICOS I. COMPLEMENTARIA RECOMENDACIONES
BACTERIAS  
Bartonella henselae IFI (IgG e IgM) Enfermedad por arañazo de gato, bacteriemia, endocarditis, hepatitis, angiomatosis bacilar Suero Gelosa tapón rojo   Sintomatología, tiempo de evolución, tratamiento antibiótico.   Suero de fase aguda y convaleciente
Bartonella quintana IFI (IgG e IgM) Fiebre de las trincheras (contacto con piojos) Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico.   Suero de fase aguda y convaleciente
Bordetella pertussis EIA IQL (IgG) Protección vacunal Suero Gelosa tapón rojo        
Borrelia spp ELFA (IgG e IgM), IB Enfermedad de Lyme Suero Gelosa tapón rojo   Síntomas   Suero de fase aguda y convaleciente
Neuroborreliosis LCR Tubo poliestireno tapón verde Enviar conjuntamente con suero    
Brucella spp. Rosa de Bengala, aglutinación, test de Coombs Brucelosis Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico.   Suero de fase aguda y convaleciente
Artritis, meningitis por Brucella Líquido articular, LCR Tubo poliestireno tapón verde Enviar conjuntamente con suero    
Clostridium tetani EIA Diagnóstico de inmunosupresión Suero Gelosa tapón rojo   Tipo de inmunosupresión, estado vacunal    
Chlamydia trachomatis IFI (IgG) ITS, tracoma y neumonía (neonatos) Suero Gelosa tapón rojo   Síntomas, tiempo de evolución Más sensibles las pruebas moleculares  
Chlamydophila pneumoniae  IFI (IgG) Neumonía Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico. Durante la fase aguda los anticuerpos son negativos Suero de fase aguda y convaleciente
Chlamydophila psittaci IFI (IgG) Neumonía tras contacto con aves Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico. Durante la fase aguda los anticuerpos son negativos Suero de fase aguda y convaleciente
Coxiella burnetii IFI fase I y fase II, (IgG e IgM) Fiebre Q Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico. Durante la fase aguda los anticuerpos son negativos Suero de fase aguda y convaleciente
Francisella tularensis EIA IQL (IgG+IgM) Tularemia Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico. Durante la fase aguda los anticuerpos son negativos Suero de fase aguda y convaleciente
Legionella pneumophila  IFI (IgG) Neumonía atípica Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico. Serogrupo 1 Suero de fase aguda y convaleciente
EIA IQL (IgG+IgM) Neumonía atípica Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico. Serogrupo 1 a 6 Suero de fase aguda y convaleciente
Leptospira spp. HAI, EIA IQL IgM Leptospirosis Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico. Contacto con animales Suero de fase aguda y convaleciente
Mycobacterium tuberculosis IGRA Contacto previo con M tuberculosis Suero Set de 4 tubos especiales de IGRA Seguir las recomendaciones en la toma de muestras Sospecha clínica, contacto con pacientes, inmunosupresión Resultado de reacción de Mantoux  
Mycoplasma pneumoniae EIA (IgM) Neumonía atípica, miopericarditis,  miopatías, anemia hemolítica Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico. Durante la fase aguda los anticuerpos son negativos Suero de fase aguda y convaleciente
Rickettsia conorii EIA IQL (IgM), IFI (IgG) Fiebre botonosa Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico.   Suero de fase aguda y convaleciente
Salmonella typhi EIA Diagnóstico de inmunosupresión Suero Gelosa tapón rojo   Tipo de inmunosupresión    
Streptococcus pneumoniae EIA Diagnóstico de inmunosupresión Suero Gelosa tapón rojo   Tipo de inmunosupresión, estado vacunal    
Treponema pallidum EIA IQL (IgG+IgM), TPHA, RPR Sífilis Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico. Durante el chancro la serología es negativa  
Neurosífilis LCR Tubo poliestireno tapón verde Enviar conjuntamente con suero Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico. Durante el chancro la serología es negativa  
Yersinia enterocolitica Aglutinación Diagnóstico serológico de infecciones por Y. enterocolitica Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico.    
Yersinia pseudotuberculosis Aglutinación Diagnóstico serológico de infecciones por Y. pseudotuberculosis Suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución, tratamiento antibiótico.    
HONGOS
Aspergillus Galactomanano ELISA, IC en fase sólida (Ag) test rápido Diagnóstico de aspergilosis invasiva y control del tratamiento Suero Gelosa tapón rojo     Los resultados positivos requieren confirmación (8-14% de falsos positivos) No aptos sueros lipémicos, hemolizados ni contaminados
BAL Tubo poliestireno tapón verde     Mayor sensibilidad que en suero  
Aspergillus Mananoproteina IC en fase sólida (Ag) test rápido Diagnóstico de aspergilosis invasiva y control del tratamiento Suero Gelosa tapón rojo        
BAL Tubo poliestireno tapón verde     Mayor sensibilidad que en suero  
Candida albicans EIA IQL (gG), IFI IgG anti-micelio Candidiasis invasiva Suero Gelosa tapón rojo        
Criptococcus neoformans antígeno Aglutinación con partículas de látex Criptococosis Suero Gelosa tapón rojo   Inmunosupresión, sintomatología Títulos bajos valorar con clínica  
LCR Tubo poliestireno tapón verde    
PARÁSITOS
Echinococcus granulosus IHA EIA IQL (IgG) Quiste hidatídico Suero Gelosa tapón rojo     Los quistes calcificados pueden ser seronegativos No aptos sueros lipémicos, hemolizados ni contaminados
Entamoeba histolytica EIA Amebiasis extra-intestinal Suero Gelosa tapón rojo        
Leishmania infantum EIA IQL (IgG) Leishmaniasis visceral Suero Gelosa tapón rojo   Antecedentes epidemiológicos    
Plasmodium falciparum IFI (IgG) Paludismo (P. falciparum o P. vivax) Suero Gelosa tapón rojo   País de origen o estancia y tiempo    
Schistosoma IgG                
Toxoplasma gondii EIA IQL (IgG e IgM y avidez) Toxoplasmosis aguda o reactivación (ID) Suero Gelosa tapón rojo     En caso de IgM positivos, se realizará test de avidez y, si baja, PCR  
Sospecha de infección cerebral, ocular o intrauterina LCR, humor acuoso o L. amniótico  Tubo poliestireno tapón verde Enviar conjuntamente con suero   Determinación recomendada: PCR   
Trypanosoma cruzi EIA IQL, IC en fase sólida (IgG) test rápido E. de chagas Sangre total, suero o plasma EDTA o gelosa tapón rojo   País de origen o estancia y tiempo Los resultados positivos deben confirmarse  
VIRUS
Virus de la hepatitis A Ig total EIA-IQL Inmunidad frente al virus de la hepatitis A Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
Virus de la hepatitis A IgM EIA-IQL Hepatitis A aguda Plasma o suero Gelosa tapón rojo Transaminasas elevadas      
Virus de la hepatitis B (VHB). Estadiaje. HBs antígeno y anticuerpos frente a HBc y HBs Diferenciar entre inmunidad, hepatitis B activa y pasada            
VHB anticuerpos frente al antígeno de superficie (aHBs) EIA-IQL (IgG) Valoración de inmunidad frente al VHB (vacunación) o estadiaje (infección activa o resuelta) Plasma o suero Gelosa tapón rojo No solicitar si vacunación reciente      
VHB antígeno de superficie (HBsAG) EIA IQL Diagnóstico de hepatitis B aguda, crónica, congénita o reactivación Plasma o suero Gelosa tapón rojo No solicitar si vacunación reciente      
VHB anticuerpos frente al antígeno core (aHBc) EIA IQL Estadiaje de hepatitis B Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
VHB anticuerpos IgM frente al antígeno core (aHBc-IgM) EIA IQL Hepatitis B aguda o reactivación Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
VHB antígeno e (HBeAG) EIA IQL Hepatitis B aguda y grado de replicación e infectividad  en hepatitis B crónica Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
VHB anticuerpos frente al antígeno e (aHBe) EIA IQL Infectividad y replicación en hepatitis B crónica y portadores inactivos Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
Virus de la hepatitis C (VHC) EIA IQL (IgG y AG) Hepatitis C activa o resuelta Plasma o suero Gelosa tapón rojo     Periodo ventana: 6-8 semanas. Para infección aguda y diferenciar activa de resuelta, solicitar carga viral  
IB (IgG) Valoración de índices bajos de anticuerpos Suero Gelosa tapón rojo        
Virus de la hepatitis delta EIA IQL (IgG) Hepatitis D aguda o reactivación Suero Gelosa tapón rojo HBsAG positivo      
Virus de la hepatitis E  EIA IQL (IgG e IgM) Hepatitis E aguda o antecedentes, inmunodeprimidos Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
Virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) EIA IQL (IgG+IgM+Ag), IC en fase sólida test rápido Virus de la inmunodeficiencia humana Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
IB (IgG) Confirmación anticuerpos específicos VIH 1 y 2 Suero Gelosa tapón rojo        
HTLV-I-II EIA IQL (IgG) Diagnóstico de infecciones asociadas a HTLV 1 o 2 Plasma o suero Gelosa tapón rojo   Diagnóstico y país de origen Los resultados positivos deben confirmarse con IB  
Adenovirus IgA ELISA (IgA) Infecciones respiratorias, conjuntivitis,  Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
Citomegalovirus  EIA IQL (IgG e IgM) Mononucleosis infecciosa inf. congénita, reactivación (ID) y control pre-trasplante Plasma o suero Gelosa tapón rojo En neonatos, enviar conjuntamente suero materno. Tiempo de evolución Prueba de elección para infección congénita: PCR en orina. Diagnóstico precoz en trasplantados y control de tratamiento: carga viral  
EIA IQL (avidez) Diferenciar infección reciente/antigua cuando anticuerpos IgM positivos Suero Gelosa tapón rojo        
Virus Chikungunya IC en fase sólida (IgM) test rápido Infección aguda o reciente Sangre total, suero o plasma EDTA o gelosa tapón rojo   Sintomatología y país de origen o de viaje reciente. Requiere pruebas complementarias para confirmar  
Virus Coxsackie (A y B) ELISA (IgA) Meningitis aséptica, mioperidarditis, enf. mano-pie-boca y otras asociadas Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
Virus Dengue ELISA (IgG), IC en fase sólida (IgG+IgM) test rápido Infección aguda,  antecedentes o control de gestantes de países endémicos Plasma o suero Gelosa tapón rojo Requiere confirmación con prueba alternativa Sintomatología y antecedentes epidemiológicos.    
Virus Epstein-Barr  EIA IQL VCA (IgG e IgM), EIA IQL EBNA (IgG), EIA IQL EARLY (IgG) Mononucleosis infecciosa, reactivación (ID), PTLD y control pre-trasplante Plasma o suero Gelosa tapón rojo   Tiempo de evolución    
Erythrovirus B19 (B19) EIA (IgG e IgM) Infeccion aguda, crónica (ID) o inmunidad Plasma o suero Gelosa tapón rojo   Motivo de la solicitud, tiempo de evolución    
Herpes simple 1 y 2 EIA IQL (IgG e IgM) Infección aguda, perinatal, reactivación (ID) y control pre-trasplante Plasma o suero Gelosa tapón rojo        
Herpes simple 2 ELISA (IgG) ITS, elección de tratamiento antiviral Suero Gelosa tapón rojo   Diagnóstico    
Parotiditis EIA IQL (IgG e IgM) Examen de salud (IgG), infección aguda, inf. Neurológica  Suero Gelosa tapón rojo        
EIA IQL ELISA (IgG) Infección vírica del SNC LCR Tubo poliestireno tapón verde Enviar conjuntamente con suero      
Rubeola EIA IQL (IgG e IgM) Examen de salud (IgG), infección aguda, inf. Congénita Suero Gelosa tapón rojo En neonatos, enviar conjuntamente suero materno.      
Sarampión EIA IQL (IgG e IgM) Examen de salud (IgG), infección aguda, inf. Neurológica  Suero Gelosa tapón rojo        
EIA IQL (IgG) Infección vírica del SNC LCR Tubo poliestireno tapón verde Enviar conjuntamente con suero      
Varicela-zoster EIA IQL (IgG e IgM) Varicela, herpes zoster e inf. perinatal Suero Gelosa tapón rojo   Sintomatología    
ELISA (IgG) Respuesta vacunal Suero Gelosa tapón rojo   Pre, postvacunación    
Varicela urgente ELFA (IgG) Estado inmunológico de la embarazada con contacto de riesgo Suero Gelosa tapón rojo Entregar directamente en Microbiología      
Virus Zika EIA IQL (IgG e IgM) Infección aguda,  antecedentes o control de gestantes de países endémicos, recien nacidos Plasma o suero Gelosa tapón rojo Requiere confirmación con prueba alternativa Sintomatología y antecedentes epidemiológicos.    

 

PERFILES SEROLOGÍA

PERFIL PRUEBAS/MICROORGANISMOS OBJETIVO DIAGNÓSTICO MUESTRA TUBO REQUISITOS DATOS CLÍNICOS RECOMENDACIONES
ARTRITIS Anticuerpos frente a Brucella, Yersinia, Treponema, Borrelia, Chlamidia, Mycoplasma, VEB, Rubeola, virus Coxsackie y Erythrovirus Estudio de artritis infecciosa Suero Gelosa tapón rojo Origen infeccioso Antecedentes orientativos  
L. articular Tubo poliestireno tapón verde Enviar conjuntamente con suero.
ADENOPATIAS Anticuerpos frente a Brucella, Bartonella, Toxoplasma, VEB, CMV y Rubeola Estudio de adenopatías Suero Gelosa tapón rojo   Especificar antecedentes de interés y localización.  En adolescentes y adultos, incluir VIH
ANEMIA HEMOLITICA Anticuerpos frente a Coxiella, Mycoplasma, VEB, CMV, Eritrovirus y VIH Estudio de anemia hemolítica Suero Gelosa tapón rojo      
CONTROL GESTACIONAL 1º TRIMESTRE Serología de VIH, VHB, sífilis y rubeola (si no constancia de inmunidad). VHC sólo en personas de riesgo o inmunodeprimidas. Chagas (inmigrantes o estancia en zona endémica) Control serológico de la embarazada según PAI ed. 2014 Suero Gelosa tapón rojo   Diagnóstico y edad gestacional  
DONANTE DE ÓRGANOS-PRETRASPLANTE Anticuerpos frente a Treponema, Toxoplasma, VEB, CMV, VHS 1 y 2 y VVZ Control serológico de donante y/o receptor de órganos Suero Gelosa tapón rojo   Especificar donante/receptor  
ENDOCARDITIS Anticuerpos frente a Bartonella, Borrelia, Coxiella, Mycoplasma y virus Coxsackie Diagnóstico serológico de endocarditis Suero Gelosa tapón rojo      
Si lo anterior es negativo, descartar Brucella y Legionella
ENFERMEDADES HEMATOLÓGICAS Anticuerpos frente a VEB, CMV, VHS 1-2, VVZ y Erythrovirus.  Estudio de infecciones virales con alteraciones hematológicas Suero Gelosa tapón rojo   Antecedentes de interés  
Añadir Leishmania y Mycoplasma si antecedentes compatibles
ERITEMA NODOSO Anticuerpos frente a Yersinia, Treponema, Chlamidia, Mycoplasma, Toxoplasma y VEB Diagnóstico serológico del eritema nodoso Suero Gelosa tapón rojo   Descartar también TBC  
Si lo anterior es negativo, descartar VIH, HBsAG, Leptospira y F.Q.
ESTUDIO DE INMUNODEFICIENCIAS Inmunidad frente a varicela, sarampión, parotiditis y rubeola Control de inmunodeficiencias Suero Gelosa tapón rojo      
EXAMEN DE SALUD E INMUNODEPRIMIDOS PRE-VACUNAL Anticuerpos frente a VIH, VHB, VHC e inmunidad frente a vacunales (varicela, sarampión, parotiditis y rubeola) Examen de salud laboral y estudio pre-vacunal en inmunodeprimidos y candidatos a tratamientos biológicos o inmunosupresores Suero Gelosa tapón rojo   Motivo de la solicitud  
FIEBRE DE ORIGEN DESCONOCIDO Y FIEBRE DE DURACIÓN INTERMEDIA Anticuerpos frente a Brucella, Rickettsia conori, FQ, VEB, CMV y VIH Estudio de causas infecciosas en FOD Suero Gelosa tapón rojo Cumplir criterios de FOD o FDI Especificar antecedentes epidemiológicos  
GUILLAIN-BARRE Anticuerpos frente a Mycoplasma, VEB, CMV, VHS, VVZ Infecciones asociadas al S. de Guillain Barre Suero Gelosa tapón rojo   Antecedentes de interés  
Si lo anterior negativo, VIH, VHB y VHC.
HEPATITIS VÍRICA AGUDA VHA (IgM), VHC y HBsAG Hepatitis vírica aguda Suero Gelosa tapón rojo Citolisis    
HEPATITIS: OTRAS CAUSAS INFECCIOSAS Anticuerpos frente a Coxiella, VEB, CMV, VHS y VVZ Estudio de otras causas de hepatitis infecciosa descartadas las hepatitis A, B y C. Suero Gelosa tapón rojo   Antecedentes de interés  
Si estos son negativos, solicitar VIH, Brucella, Treponema, Borrelia y Leptospira
INFECCIÓN . CONGENITA/PERINATAL Anticuerpos frente a Treponema, Toxoplasma, CMV, VHS, VVZ, Rubeola, virus Coxsackie y Erythrovirus Estudio de infecciones congénitas o perinatales Suero Gelosa tapón rojo Muestra simultánea de madre e hijo Antecedentes de interés  
INFECCONES DE TRANSMISIÓN SEXUAL Anticuerpos frente a Treponema, C. trachomatis y VHS-2 Infecciones por estos microorganismos Suero Gelosa tapón rojo   En la fase de chancro la serología de sífilis es negativa Se recomienda estudio por PCR de exudado genital/orina
INFECCIONES RESPIRATORIAS EN LA INFANCIA Anticuerpos frente a Legionella. C. pneumoniae, C. psitacci y C. trachomatis, Mycoplasma y Adenovirus Infecciones respiratorias de la infancia por microorganismos no cultivables Suero Gelosa tapón rojo Enviar muestra de fase aguda y convaleciente (15 días después) Especificar tiempo de evolución y tratamiento antibiótico  
MARCADORES DE HEPATITIS Y VIH Anticuerpos frente al VIH, VHC y estadiaje del VHB(HBsAG, anti-HBc y anti-HBs) Examen de salud, pre-anestesia Suero Gelosa tapón rojo      
MIOPATIAS Anticuerpos frente a Treponema, Borrelia, Coxiella, Mycoplasma, Toxoplasma, Echinococcus, VEB, virus Coxsackie, Adenovirus y VIH Estudio de miopatías infecciosas Suero Gelosa tapón rojo      
MIOPERICARDITIS Anticuerpos frente a Legionella, Borrelia, Mycoplasma, CMV, virus Coxsackie y Adenovirus. Miopericarditis infecciosa Suero Gelosa tapón rojo   Antecedentes de interés  
L. pericárdico Tubo poliestireno tapón verde Enviar conjuntamente con suero.
MONONUCLEOSIS INFECCIOSA Anticuerpos frente a VEB y CMV (IgM). Mononucleosis infecciosa Suero Gelosa tapón rojo   Especificar antecedentes de interés y localización de adenopatías Si alta sospecha de infección VIH, solicitar carga viral
Anticuerpos frente a Toxoplasma (si adenopatía única o asimétricas
Si adolescente o adulto, solicitar VIH y, si negativo, repetir a las 3 semanas
NEUMONIA ATIPICA Anticuerpos frente a Legionella, Coxiella,  Mycoplasma, Chlamidia y Adenovirus Neumonía atípica en fase convaleciente Suero Gelosa tapón rojo Enviar muestra de fase aguda y convaleciente (15 días después) Especificar tiempo de evolución y tratamiento antibiótico  
NEUROTROPOS Anticuerpos en LCR y suero frente a Brucella, Treponema, Borrelia, Toxoplasma, virus VEB, CMV, VHS, VVZ, Sarampión, Parotiditis y Coxsackie. Antígeno de criptococo   Diagnóstico de infecciones del SNC en fase convaleciente Suero Gelosa tapón rojo Suero y LCR extraídos el mismo día  Diagnóstico y antecedentes de interés  
LCR Tubo poliestireno tapón verde
PRETRASPLANTE M. ÓSEA Serología de VIH y VHC (si seronegativos), VHB, sífilis, toxoplasma, VEB, CMV, VHS 1-2, VVZ. Antígeno de Aspergillus. Control serológico pre-trasplante de M.O. Suero Gelosa tapón rojo      
RASH CUTANEO Anticuerpos frente a Treponema, R. conori, VEB, VHS 1-2, VVZ, Sarampión, Rubeola, Coxsackie, Adenovirus y Erythrovirus B19. Infecciones exantemáticas  Suero Gelosa tapón rojo Definir el exantema (eritematoso, máculopapular, vesicular, etc.) Si clínica y antecedentes compatibles, añadir E. de Lyme
SEGUIMIENTO VIH Serología de sífilis, toxoplasma y CMV Control de pacientes VIH+ Suero Gelosa tapón rojo      
SÍNDROME CONSTITUCIONAL Anticuerpos frente a VIH, VHC, VHB, Brucella, Treponema y CMV Estudio serológico del síndrome constitucional Suero Gelosa tapón rojo      
TRASPLANTE-INMUNODEPRESIÓN Anticuerpos frente a VIH y VHC (si seronegativos), VHB, Toxoplasma, VEB, CMV, VHS 1-2 y VVZ. Antígeno de Criptococcus Control de infecciones o reactivaciones en pacientes inmunodeprimidos Suero Gelosa tapón rojo   Causa de ID  

 

MICROBIOLOGÍA MOLECULAR

MICROORGANISMO TÉCNICA OBJETIVO DIAGNÓSTICO MUESTRA TUBO REQUISITOS DATOS CLÍNICOS
BACTERIAS
Gen 16S ARNr PCR + secuenciación Identificación de bacterias en muestras de origen estéril con cultivo negativo Válvula cardiaca, LCR, prótesis biopsia y otras Envase estéril Cultivo previo negativo Cuadro clínico, antecedentes, tratamiento.
Bordetella pertussis y Bordetella parapertussis PCR multiplex a TR Tosferina Aspirado nasofaríngeo Tubo poliestireno tapón verde Fuerte sospecha clínica Cuadro clíniico, antecedentes, tratamiento
Exudado nasal + exudado faríngeo Escobillones con medio de transporte líquido universal
Borrelia burgdorferi PCR a TR E. de Lyme en fase inicial (eritema migrans) o tardía (artritis, afectación neurológica o cardiaca). Complementario a  serología. Biopsia cutánea Envase estéril Fase aguda (primeras 2-4 semanas) Cuadro clínico, antecedentes, tratamiento.
E. de Lyme en fase tardía (artritis, afectación neurológica o cardiaca). LCR, articular, percárdico Tubo poliestireno tapón verde Leucocitosis, proteínas elevadas. Serología positiva
Complementario a serología. Plasma Gelosa tapón nácar Serología positiva de interpretación dudosa
Chlamydia trachomatis LGV PCR a TR  Linfogranuloma venéreo Exudado genital y anorrectal Escobillones con medio de transporte líquido universal PCR positiva a C trachomatis Cuadro clíniico, antecedentes, tratamiento
Clostridium difficle PCR multiplex a TR (tox B, toxina binaria, ribotipo 027) Diagnóstico de infección por C difficile Heces Contenedor esteril Muestra diarréica Cuadro clíniico, antecedentes, tratamiento
Mycobacterium tuberculosis complex; resistencia a rifampicina PCR a TR  TBC en muestras de origen estéril. En BK+, identificación de  MTBc. Si positivo, Identificación de genes de resistencia a rifampicina.   LCR, pleural, biopsia y muestras respiratorias/orina BK+ Contenedor estéril Clinica y estudios complementarios sospechosos Cuadro clíniico, antecedentes, tratamiento
M. tuberculosis complex MDR/XDR PCR multiplex a TR Detección en MTBc de genes de resistencia a isoniazida, rifampicina, fluoroquinolonas, kanamicina y capreomicina Muestras BK+ o cepas aisladas con sospecha de multirresistencia Contenedor estéril BK+ con sospecha epidemiológica de multirresistencia Cuadro clíniico, antecedentes epidemiológicos, tratamiento
Tropheryma whipplei PCR a TR Enfermedad de Whipple Biopsia duodenal, LCR Contenedor estéril Clinica y estudios complementarios sospechosos Cuadro clíniico, antecedentes, tratamiento
HONGOS
Aspergillus spp PCR a TR Infección respiratoria en inmunodeprimidos BAL, esputo Contenedor estéril y medio de transporte líquido universal Clinica y estudios complementarios sospechosos Cuadro clínico, tratamiento
Pneumocystis jiroveci PCR a TR Infección respiratoria en inmunodeprimidos BAL, esputo Contenedor estéril y medio de transporte líquido universal Clinica y estudios complementarios sospechosos Cuadro clínico, tratamiento
PARÁSITOS
Toxoplasma gondii PCR a TR Toxoplasmosis cerebral, ocular, en la embarazada o congénita Plasma Gelosa tapón nácar Presencia de anticuerpos, estudios complementarios compatibles Cuadro clíniico, antecedentes, tratamiento
L. amniótico, ocular, biopsia Contenedor estéril
VIRUS
Adenovirus CV PCR a TR Infecciones en TMO, principalmente niños Plasma Gelosa tapón nácar   Diagnóstico justificativo
Virus BK CV PCR a TR Diagnóstico y control de la nefropatía asociada a VBK en trasplantados renales Plasma Gelosa tapón nácar    
Citomegalovirus CV PCR a TR Detección y cuantificación de viremia, control de evolución y respuesta al tratamiento Plasma Gelosa tapón nácar   Cuadro clínico, motivo de la solicitud
Virus Epstein-Barr CV PCR a TR Enfermedad linfoproliferativa post-trasplante (prevención y control del tto) y linfoma relacionado con SIDA Plasma Gelosa tapón nácar   Diagnóstico justificativo
Enterovirus PCR a TR directo sobre muestra Meningitis linfocitarias, encefalitis LCR Tubo poliestireno tapón verde Estudios complementarios compatibles Cuadro clínico
Erythrovirus B19 PCR a TR Infecciones por B19 en embarazadas e ID fundamentalmente Plasma Gelosa tapón nácar   Cuadro clínico, motivo de la solicitud
L. amniótico Tubo poliestireno tapón verde
Virus herpes simple 1 y 2, virus varicela-zoster PCR multiplex a TR Infecciones asociadas Exudado de las lesiones Escobillones con medio de transporte para virus ViralPack o sin medio de transporte   Cuadro clínico, motivo de la solicitud
LCR Tubo poliestireno tapón verde
Influenza A, B, A(H1N1) PCR multiplex a TR directo sobre muestra Gripe Aspirado nasofaríngeo Tubo poliestireno tapón verde Cuadro grave, embarazadas o inmunodeprimidos. No estudio de contactos. Cuadro clíniico, antecedentes, tratamiento
Exudado nasal + exudado faríngeo Escobillones con medio de transporte para virus ViralPack 
VHB CV PCR a TR Distinguir infección activa de inactiva, HBO, control  de la HBC, control de tratamiento y diagnóstico precoz. Plasma Gelosa tapón nácar HBsAG positivo o antecedentes de hepatitis B en inmunodeprimidos Fase del tratamiento, causa de la inmunodepresión, control de hepatitis B crónica.
VHB genotipado Secuenciación masiva Identificación de mutaciones que afectan a la evolución, a la respuesta al tto o la vacuna Plasma o suero Gelosa tapón nácar Impreso de solicitud, CV >1000 y 3 ml de plasma  
VHB estudio de resistencias Secuenciación masiva Identificación de mutaciones asociadas a resistencias Plasma o suero Gelosa tapón nácar Fracaso de tratamiento, CV>1000 y 3 ml de plasma Tratamiento previo
VHC CV PCR a TR Infección aguda (periodo ventana), confirmación de inf. crónica y control de tratamiento Plasma Gelosa tapón nácar Entrega inmediata (la muestra debe ser centrifugada antes de 4 h) Finalidad de la prueba y/o semana del tratamiento
VHC genotipado PCR a TR Elección del tratamiento Plasma Gelosa tapón nácar CV>500 UI/ml  
VHC genotipado por secuenciación Secuenciación masiva Identificar genotipos cuando la PCR-TR no lo hace Plasma o suero Gelosa tapón nácar    
VHC estudio de resistencias Secuenciación masiva Identificación de mutaciones asociadas a resistencia Plasma Gelosa tapón nácar Fracaso de tratamiento o genotipo 1a  
Virus de la hepatitis E (CV) PCR a TR Infección aguda y crónica por VHE Plasma Gelosa tapón nácar Estudios complementarios compatibles Cuadro clínico
VIH carga viral (CV) PCR a TR Estadiaje de la infección, control del TAR y diagnóstico de inf. Congénita y aguda Plasma Gelosa tapón nácar Entrega inmediata (la muestra debe ser centrifugada antes de 4 h)  
VIH estudio de resistencias Secuenciación masiva Identificación de mutaciones asociadas a resistencia a los ARV Plasma Gelosa tapón nácar Impreso de solicitud, CV >1000 y 3 ml de plasma  
VIH Subtipo Secuenciación masiva Epidemiología y previsión de respuesta al TAR Plasma Gelosa tapón nácar CV>1000 y 3 ml de plasma  
VIH tropismo Secuenciación masiva Intención de uso de antagonistas del receptor CCR5 Plasma Gelosa tapón nácar CV>1000 y 3 ml de plasma  
Virus JC PCR a TR LMP LCR Tubo poliestireno tapón verde Estudios complementarios compatibles Cuadro clínico
Virus Dengue PCR a TR Dengue Plasma Gelosa tapón nácar Estudios complementarios compatibles Cuadro clínico
Virus Zika PCR a TR Infección por virus Zika Plasma, suero, orina EDTA, gelosa tapón rojo, contenedor estéril Estudios complementarios compatibles Cuadro clínico
Virus Toscana PCR a TR Meningitis por virus Toscana LCR Tubo poliestireno tapón verde Estudios complementarios compatibles. Descartado otros posibles patógenos Cuadro clínico
Virus del papiloma humano (VPH) PCR multiplex a TR (cribado + genotipado específico de19 genotipos de alto riesgo y 9 de bajo riesgo) Diagnóstico precoz del cáncer de cérvix y de otras lesiones asociadas al VPH; despistaje. Control de la infección. Exudados genitales, perirrectales,  frotis de verrugas, exudado faríngeo, orina  Escobillones con medio de transporte para virus ViralPack o sin medio de transporte   Descripción de la lesión o motivo de la solicitud.
SÍNDROMES

Herpesvirus humanos        

VHS 1 y 2, VVZ, CMV, VEB, VHH 6

PCR multiplex a TR Meningitis herpética, encefalitis, inmunosupresión LCR Tubo poliestireno tapón verde Clínica y estudios complementarios compatibles Cuadro clínico, antecedentes de interés
Inmunosupresión Plasma o suero EDTA, gelosa tapón rojo

Neumonía atípica + tosferina                            

B. pertussis, B. parapertussis, Chlamydophila pneumoniae, Chlamydophila psittaci, Legionella pneumophila

PCR multiplex a TR Neumonía atípica Esputo, BAL, aspirado o escobillón nasofaríngeo Contenedor estéril, medio de transporte líquido universal Sospecha clínica/radiológica de neumonía atípica.  Cuadro clíniico, antecedentes, tratamiento

Panel meningoencefalitis

E coli K1, H influenzae, L monocytogenes, N meningiditis, S agalactiae, S penumoniae, C neoformans/gattii, CMV, enterovirus, VHS-1, VHS-2, VHH-6, Parechovirus, varicela/zoster

PCR multiplex a TR Meningoencefalitis LCR Tubo poliestireno tapón verde Clínica y estudios complementarios compatibles Cuadro clínico, antecedentes de interés

Panel respiratorio

Adenovirus, Coronavirus, Metapneumovirus, Rhinovirus/Enterovirus, Influenza A-B, Parainfluenza 1-4, VRS, B pertussis. B parapertussis, C pneumoniae, M pneumoniae 

PCR multiplex a TR Infección respiratoria Esputo, BAL, aspirado o escobillón nasofaríngeo Contenedor estéril, medio de transporte líquido universal Clínica y estudios complementarios compatibles Cuadro clínico, antecedentes de interés

Panel gastrointestinal

Campylobacter, C difficile, P shigelloides, Y enterocolitica, Vibrio, E coli, Adenovirus, Astrovirus, Norovirus, Rotavirus, Sapovirus, Cryptosporidium, C cayetanensis, E histolytica, G lamblia

PCR multiplex a TR Diarrea Heces Contenedor esterial Clínica y estudios complementarios compatibles Cuadro clínico, antecedentes de interés

Gastroenteritis bacteriana

Campylobacter, C difficile, Salmonella, Shigella, Vibrio, Y enterocolitica, Aeromonas, E coli

PCR multiplex a TR Diarrea Heces Contenedor esterial Clínica y estudios complementarios compatibles Cuadro clínico, antecedentes de interés

Úlcera genital

VHS-1, VHS-2, varicela/zóster, CMV, LGV, C trachomatis LGV, T pallidum, H ducreyi

PCR multiplex a TR Diagnóstico de úlcera genital Exudado de úlcera genital Escobillones con medio de transporte líquido universal Clínica y estudios complementarios compatibles Cuadro clínico, antecedentes de interés

Uretritis

Chlamydia trachomatis-Neisseria gonorrhoeae (CT-NG)

PCR multiplex a TR Uretritis y otras I.T.S. Exudados genitales, perirrectales y faríngeos Escobillones con medio de transporte líquido universal Muestra tomada por especialista Cuadro clínico, motivo de la solicitud
Orina (menor sensibilidad en mujeres) Contenedor de orina 1ª orina de la mañana

Uretritis y otras ITS

C. trachomatis, N. gonorrhoeae, Mycoplasma hominis, Mycoplasma genitalium, Ureaplasma hominis, Ureaplasma parvum y Trichomonas vaginalis

PCR multiplex a TR UNG y otras ITS, prostatitis, EPI, complicaciones del embarazo asociadas (aborto, parto prematuro, rotura prematura de membrana), infecciones del recién nacido. Exudados genitales Escobillones con medio de transporte líquido universal Muestra tomada por especialista Cuadro clínico, motivo de la solicitud
Orina (menor sensibilidad en mujeres) Contenedor de orina 1ª orina de la mañana
L. amniótico y otras Tubo poliestireno tapón verde o contenedor de orina  

Vaginosis/Vaginitis

Gardnerella, Candida, Trichomonas

PCR multiplex a TR Diagnóstico de vaginitis y vaginosis Exudado vaginal Escobillones con medio de transporte líquido universal